棉花配額的申請期為每年的10月下旬，受理機構為國家發改委授權機構（地方發改委）負責本地區的配額申請，并在年底發放下一年度的進口報關配額。
關稅配額證明分兩種：
1、關稅配額外優惠關稅稅率進口棉花配額證：指對于一定數量的關稅配額外報關進口的棉花按“暫定優惠關稅稅率”征收進口關稅，由國家發展改革委授權機構出具《關稅配額外優惠關稅稅率進口棉花配額證》。
2、配額內：進口時由商務部簽發《關稅配額證明》
如果進口報關企業不申領配額證明的， 2019年的進口關稅率為40%。
所需要交給進口報關行的文件:
1. 合同、發票、提單；
2.明細碼單/裝箱單
3.品質/重量證明
4.產地證明
5. 植物檢疫證明
6. 進口棉花境外供貨企業登記證書
7.提貨單
8.配額證明（需要時提供）
9.關稅配額外優惠關稅稅率進口棉花配額證（需要時提供）
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