還有一種比較特殊的情況：牽涉到第三方，中間商不想讓最終的客戶知道貨物的來源等其他信息，就有可能要求簽發貨代單，以達到保護商業秘密的目的。
簽發船東單對發貨人和貨代來說都是比較安全的選擇。對發貨人來講船東的信譽和安全系數肯定要比貨代強，一般情況下都會相信船東，和船東比較對貨代肯定有幾分不放心。對貨代來說也比較安全，不需要用到代理，萬一代理卷貨走人，貨代算是白干了，甚至跟著倒閉。所以整柜出口不到萬不得以貨代不是很愿意簽發貨代單。
費用問題：船東單目的港提貨一般不會產生什么費用，貨代單提貨肯定會收取目的港客戶的換單費（也有可能由發貨人支付給貨代，貨代另行和代理結算）。
