根據企業實際生產單損耗向海關申報備案加工貿易手冊和賬冊，并根據生產情況的變化，同步變更手冊/賬冊。如此保證備案信息的正確性，是否就能避免在庫誤差呢？保持正確備案內容是重要的第一步，使用和管理手冊/賬冊則更為重要。然而并不是所有的生產方式都適用手冊/賬冊的管理，例如同一種成品，在同一時間段，有兩種不同的生產組裝方式，有兩套不同的單損耗數據。這種情況很難管理，不可避免會造成大量的在庫誤差。
集成了多種電子元件的線路板幾乎是電子產品必備的零部件，是將各種電子元器件焊接在覆銅板上生產而成的。大型的生產企業擁有自動焊接設備，可以進口覆銅板和電子元器件生產成品所需要的線路板。在經營生產過程中，由于滿足訂單量和控制成本的原因，也可能從其他企業直接進口相同的線路板。這樣成品就存在兩種完全不同的單損耗，一種是耗用1塊覆銅板和上百個電子元器件，另一種是耗用1塊線路板。手冊/賬冊需要分開兩項成品來備案。
兩種不同組裝方式生產的成品，在外觀上無法區分，產品規格型號也沒有區別，出口通關時無法正確區分成兩項成品申報。錯誤混淆申報的結果就是造成大量的在庫誤差，例如線路板的理論在庫為負值，而覆銅板和電子元件則存在在庫短少，或者是相反的結果。
如果企業無法從實物上區分上述成品，就無法按實際生產情況出口申報。無論是按比例出口，按生產計劃出口，按進口量倒推出口量等等數據區分方法，都無法避免在庫誤差。此時就需要通關部門和相關生產部門達成共識，避免上述情況發生，禁止同一種成品，在同一時間段，有兩種不同的生產組裝方式存在。否則企業的手冊/賬冊將累積大量的在庫誤差，不僅是通關風險，也是企業經營風險，一旦被海關處罰，將對正常的經營生產造成更大的影響。
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